Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT1P21579 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT1P21579 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT1P21579 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT1P21579 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT1P21579 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT1P21579 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT1P21579 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT1P21579 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms