Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB8P17481 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB8P17481 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB8P17481 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB8P17481 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms