Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms