Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODC1P11926 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODC1P11926 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODC1P11926 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODC1P11926 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODC1P11926 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODC1P11926 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODC1P11926 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODC1P11926 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODC1P11926 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODC1P11926 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODC1P11926 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ODC1P11926 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODC1P11926 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODC1P11926 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODC1P11926 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms