Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CD28P10747 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD28P10747 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD28P10747 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CD28P10747 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD28P10747 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD28P10747 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD28P10747 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD28P10747 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD28P10747 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD28P10747 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD28P10747 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD28P10747 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD28P10747 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD28P10747 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CD28P10747 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD28P10747 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD28P10747 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CD28P10747 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms