Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXD4P09016 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms