Protein–RNA interactions for Protein: P01127

PDGFB, Platelet-derived growth factor subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFBP01127 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDGFBP01127 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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