Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC1O94876 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms