Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms