Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms