Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C4orf47A7E2U8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C4orf47A7E2U8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C4orf47A7E2U8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C4orf47A7E2U8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C4orf47A7E2U8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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C4orf47A7E2U8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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C4orf47A7E2U8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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C4orf47A7E2U8 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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