Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YBX2Q9Y2T7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms