Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms