Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SNX6Q9UNH7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SNX6Q9UNH7 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SNX6Q9UNH7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SNX6Q9UNH7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SNX6Q9UNH7 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SNX6Q9UNH7 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SNX6Q9UNH7 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SNX6Q9UNH7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SNX6Q9UNH7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SNX6Q9UNH7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SNX6Q9UNH7 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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