Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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