Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms