Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms