Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKIRAS1Q9NYS0 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKIRAS1Q9NYS0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms