Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms