Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLIRPQ9GZT3 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLIRPQ9GZT3 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLIRPQ9GZT3 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLIRPQ9GZT3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLIRPQ9GZT3 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLIRPQ9GZT3 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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