Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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