Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC94Q9BW85 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms