Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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