Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms