Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3AQ96ST3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms