Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SORCS2Q96PQ0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms