Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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