Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

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Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 AC111000.1-201ENST00000514545 713 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AC079988.1-201ENST00000432984 544 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 SEC11A-202ENST00000455959 1223 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 SEC11A-209ENST00000560266 1089 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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CNKSR2Q8WXI2 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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CNKSR2Q8WXI2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AC008972.1-201ENST00000607027 640 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 MYLK-220ENST00000578202 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNKSR2Q8WXI2 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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