Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLEC4CQ8WTT0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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