Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms