Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms