Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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