Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms