Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TPTE2Q6XPS3 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms