Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHDC7AQ5VTJ3 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHDC7AQ5VTJ3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHDC7AQ5VTJ3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHDC7AQ5VTJ3 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms