Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC93Q567U6 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms