Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DGKZ-220ENST00000532868 3118 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ITIH1-201ENST00000273283 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FUT6-201ENST00000286955 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 C8orf17-202ENST00000625034 2775 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HECTD3-201ENST00000372168 2530 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SUGP1-201ENST00000247001 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FBLN5-201ENST00000267620 2423 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PHACTR3-205ENST00000395636 2372 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC36-204ENST00000452691 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LMOD3-203ENST00000489031 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GDPD2-201ENST00000374382 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC131888.1-201ENST00000625028 2168 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CD36-207ENST00000432207 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TNFSF10-202ENST00000420541 1619 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PRLR-211ENST00000511486 1566 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms