Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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