Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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