Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PTPROQ16827 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PTPROQ16827 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PTPROQ16827 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PTPROQ16827 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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PTPROQ16827 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PTPROQ16827 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PTPROQ16827 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PTPROQ16827 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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