Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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ZNF239Q16600 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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ZNF239Q16600 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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