Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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GABRA6Q16445 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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GABRA6Q16445 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
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GABRA6Q16445 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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GABRA6Q16445 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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GABRA6Q16445 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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GABRA6Q16445 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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GABRA6Q16445 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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GABRA6Q16445 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABRA6Q16445 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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