Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATP6AP1Q15904 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms