Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LPGAT1-202ENST00000366997 7782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CDH1-212ENST00000611625 4878 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CR2-203ENST00000367059 3877 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SCN5A-209ENST00000451551 8343 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ARSJ-201ENST00000315366 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 OTOG-203ENST00000399397 9948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 FHDC1-201ENST00000260008 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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