Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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ZNHIT3Q15649 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ZNHIT3Q15649 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ZNHIT3Q15649 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ZNHIT3Q15649 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNHIT3Q15649 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNHIT3Q15649 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNHIT3Q15649 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNHIT3Q15649 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNHIT3Q15649 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNHIT3Q15649 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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