Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PUM3Q15397 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PUM3Q15397 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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PUM3Q15397 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PUM3Q15397 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PUM3Q15397 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PUM3Q15397 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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