Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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HERC3Q15034 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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HERC3Q15034 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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HERC3Q15034 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HERC3Q15034 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HERC3Q15034 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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