Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SSPNQ14714 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SSPNQ14714 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SSPNQ14714 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SSPNQ14714 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SSPNQ14714 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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