Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms