Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APOFQ13790 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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